Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 HEPH-207ENST00000458621 838 ntTSL 28.67□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 28.1
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TARDBPQ13148 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 28.1
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TARDBPQ13148 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 28.1
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TARDBPQ13148 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 28
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TARDBPQ13148 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.771e-6■■■■■ 28
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TARDBPQ13148 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 UIMC1-204ENST00000503273 955 ntTSL 59.2□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 UIMC1-213ENST00000512031 2467 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 27.9
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TARDBPQ13148 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.693e-8■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.066e-9■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 DLG5-206ENST00000468332 5505 ntTSL 212.19□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 27.9
TARDBPQ13148 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 319.23■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 27.8
TARDBPQ13148 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 27.8
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