Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ECH1Q13011 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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