Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF2Q12933 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRAF2Q12933 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF2Q12933 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms