Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN13Q12923 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms