Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 215.84■□□□□ 0.139e-10■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.039e-10■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-211ENST00000441357 991 ntTSL 314.41□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 313.82□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 LINC01194-201ENST00000505196 540 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NOL4L-204ENST00000375677 541 ntTSL 311.72□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.564e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.626e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.686e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-201ENST00000321233 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-212ENST00000580759 572 ntTSL 510.3□□□□□ -0.764e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-210ENST00000579634 580 ntTSL 39.66□□□□□ -0.864e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-214ENST00000582165 592 ntTSL 58.57□□□□□ -1.044e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.094e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.116e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.126e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.134e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.146e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.186e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.246e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 56.93□□□□□ -1.36e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 CNOT10-203ENST00000416457 2096 ntTSL 26.49□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.536e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.576e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-208ENST00000578918 580 ntTSL 45.27□□□□□ -1.574e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-206ENST00000577324 1005 ntTSL 24.98□□□□□ -1.614e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.624e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.794e-8■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 ZNF207-205ENST00000394679 847 ntTSL 33.59□□□□□ -1.834e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PPA1-203ENST00000460755 412 ntTSL 52.76□□□□□ -1.976e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AC005899.4-202ENST00000578389 429 ntTSL 22.66□□□□□ -1.984e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 PPA1-204ENST00000495346 282 ntTSL 32.51□□□□□ -2.016e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.084e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-220ENST00000544692 2221 ntTSL 519.71■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)19.18■□□□□ 0.662e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NCKIPSD-209ENST00000470006 814 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-206ENST00000534922 1660 ntTSL 318.6■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-204ENST00000441786 556 ntTSL 518.38■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.312e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZBTB1-204ENST00000555321 629 ntTSL 416.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-221ENST00000544870 659 ntTSL 316.2■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 ZBTB1-202ENST00000553583 582 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-211ENST00000538196 551 ntTSL 412.57□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 22.8
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ILF3Q12906 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.492e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.663e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-208ENST00000414883 885 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 510.52□□□□□ -0.733e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NCKIPSD-202ENST00000413374 725 ntTSL 310.12□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.042e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 N4BP1-203ENST00000564710 540 ntTSL 48.42□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 38.2□□□□□ -1.13e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-209ENST00000473480 813 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.442e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.582e-8■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NRIP1-204ENST00000411932 720 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.762e-12■■■■□ 22.8
ILF3Q12906 ZBTB1-206ENST00000556965 509 ntTSL 42.61□□□□□ -1.992e-6■■■■□ 22.8
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