Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 KRI1YNL308C 1776 nt4.13□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 RBA50YDR527W 1320 nt4.13□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 SEC17YBL050W 879 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 VTC3YPL019C 2508 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 UGA3YDL170W 1587 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 GCD6YDR211W 2139 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 CNL1YDR357C 369 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 LSM12YHR121W 564 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.12□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 ABP140YOR239W 1887 nt4.11□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 ERG28YER044C 447 nt4.11□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YLR036CYLR036C 612 nt4.11□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YGK3YOL128C 1128 nt4.11□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 SRC1YML034W 2505 nt4.11□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 FCF1YDR339C 570 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YHR213WYHR213W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YAL037WYAL037W 804 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YAR062WYAR062W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 KIP1YBL063W 3336 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 BEM4YPL161C 1902 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 FRE1YLR214W 2061 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 TDA11YHR159W 1515 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 PEP1YBL017C 4740 nt4.1□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 PTR2YKR093W 1806 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YDL124WYDL124W 939 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 PHD1YKL043W 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 LDS2YOL047C 1071 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 AUS1YOR011W 4185 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YLR177WYLR177W 1887 nt4.09□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 GRX6YDL010W 696 nt4.09□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YLR352WYLR352W 2424 nt4.09□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 CDC6YJL194W 1542 nt4.08□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 MAF1YDR005C 1188 nt4.08□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YOR050CYOR050C 348 nt4.08□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 SEN1YLR430W 6696 nt4.08□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 FUN12YAL035W 3009 nt4.07□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 BCK1YJL095W 4437 nt4.07□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 PAU14YIL176C 363 nt4.07□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 PAU1YJL223C 363 nt4.07□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YKL169CYKL169C 384 nt4.07□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 RIM4YHL024W 2142 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 SSY1YDR160W 2559 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 RGR1YLR071C 3249 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YIL163CYIL163C 354 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YMR082CYMR082C 357 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 RIB5YBR256C 717 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 TYR1YBR166C 1359 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 MSN2YMR037C 2115 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YCR101CYCR101C 549 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 VTC1YER072W 390 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 RPL33AYPL143W 324 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 SSQ1YLR369W 1974 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 TCO89YPL180W 2400 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 SFH5YJL145W 885 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 LAC1YKL008C 1257 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 YLR255CYLR255C 354 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 PRE2YPR103W 864 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 MRPL37YBR268W 318 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2B-BQ12491 DAP2YHR028C 2457 nt4.03□□□□□ -1.76
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TY2B-BQ12491 RBL2YOR265W 321 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 TRE2YOR256C 2430 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YDR061WYDR061W 1620 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 RRD2YPL152W 1077 nt4.02□□□□□ -1.77
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TY2B-BQ12491 MIC27YNL100W 705 nt4□□□□□ -1.77
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TY2B-BQ12491 PTI1YGR156W 1278 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 MDM38YOL027C 1722 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 PSY1YKL076C 384 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 MCA1YOR197W 1299 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 DGA1YOR245C 1257 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 RSA1YPL193W 1146 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 MSB1YOR188W 3414 nt3.98□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 SWP1YMR149W 861 nt3.98□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 PPA2YMR267W 933 nt3.98□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 END3YNL084C 1050 nt3.98□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 RPB8YOR224C 441 nt3.98□□□□□ -1.77
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TY2B-BQ12491 MDM30YLR368W 1797 nt3.98□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YLL017WYLL017W 312 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YAR070CYAR070C 300 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YPL039WYPL039W 951 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 UBP15YMR304W 3693 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 SPT4YGR063C 309 nt3.97□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 PUT3YKL015W 2940 nt3.96□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 APL5YPL195W 2799 nt3.96□□□□□ -1.77
TY2B-BQ12491 YHR080CYHR080C 4038 nt3.96□□□□□ -1.78
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