Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP1Q09161 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms