Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP4Q09028 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RBBP4Q09028 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RBBP4Q09028 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms