Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf54Q08AI8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms