Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCL9Q07325 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCL9Q07325 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCL9Q07325 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms