Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN1Q05586 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms