Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX2Q04743 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX2Q04743 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms