Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBXN1Q04323 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms