Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID5AQ03989 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID5AQ03989 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms