Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG1Q02413 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms