Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPEQ02224 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms