Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD4Q01804 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms