Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYBPC1Q00872 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYBPC1Q00872 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms