Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDKL1Q00532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDKL1Q00532 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL1Q00532 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL1Q00532 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms