Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC1P78348 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC1P78348 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms