Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC5P78333 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC5P78333 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC5P78333 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC5P78333 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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