Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNRPD3P62318 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms