Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UFM1P61960 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UFM1P61960 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UFM1P61960 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFM1P61960 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFM1P61960 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFM1P61960 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UFM1P61960 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UFM1P61960 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UFM1P61960 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UFM1P61960 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UFM1P61960 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UFM1P61960 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UFM1P61960 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UFM1P61960 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms