Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFC1-1P60608 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVFC1-1P60608 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms