Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN1P60606 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN1P60606 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms