Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVFRD-1P60508 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms