Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPI1P60174 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPI1P60174 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPI1P60174 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPI1P60174 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPI1P60174 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPI1P60174 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPI1P60174 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPI1P60174 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPI1P60174 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPI1P60174 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPI1P60174 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms