Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3S2P59780 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP3S2P59780 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms