Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNB3P54284 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNB3P54284 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms