Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2A1P52655 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms