Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RND2P52198 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RND2P52198 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RND2P52198 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RND2P52198 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RND2P52198 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RND2P52198 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RND2P52198 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RND2P52198 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RND2P52198 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RND2P52198 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RND2P52198 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RND2P52198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms