Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMAN1P49257 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms