Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AMTP48728 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMTP48728 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMTP48728 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMTP48728 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AMTP48728 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AMTP48728 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMTP48728 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMTP48728 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMTP48728 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms