Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNC1P48547 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNC1P48547 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNC1P48547 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNC1P48547 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms