Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GNPDA1P46926 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNPDA1P46926 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms