Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms