Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATRXP46100 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRXP46100 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATRXP46100 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATRXP46100 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATRXP46100 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRXP46100 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRXP46100 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRXP46100 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms