Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATA4P43694 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GATA4P43694 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms