Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THPOP40225 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THPOP40225 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THPOP40225 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
THPOP40225 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THPOP40225 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THPOP40225 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THPOP40225 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THPOP40225 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THPOP40225 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms