Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CFHR2P36980 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CFHR2P36980 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms