Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP214P35658 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP214P35658 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP214P35658 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NUP214P35658 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP214P35658 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP214P35658 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP214P35658 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms