Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-206ENST00000447927 932 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.527e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.427e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ANKRD17-210ENST00000561029 2717 ntTSL 526.24■■□□□ 1.795e-8■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.095e-8■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-218ENST00000556158 849 ntTSL 326.65■■□□□ 1.862e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-209ENST00000554602 652 ntTSL 526.41■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-207ENST00000553495 577 ntTSL 324.61■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-213ENST00000555799 813 ntTSL 322.39■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-224ENST00000557693 593 ntTSL 314.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.054e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 216.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 510.15□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 39.36□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 317.48■□□□□ 0.392e-13■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-13■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 320.9■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.331e-6■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 14e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-222ENST00000484526 2969 ntTSL 220.11■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-218ENST00000462004 582 ntTSL 416.4■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-216ENST00000443318 565 ntTSL 315.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-224ENST00000496300 1569 ntTSL 515.46■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-215ENST00000441168 555 ntTSL 414.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ANKMY1-217ENST00000459901 3936 ntTSL 412.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.459e-9■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.49e-9■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.159e-9■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 519.42■□□□□ 0.78e-9■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 315.43■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-209ENST00000588169 1700 ntTSL 220.79■□□□□ 0.923e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-212ENST00000589426 2033 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-211ENST00000589425 1944 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-202ENST00000585521 721 ntTSL 518.33■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-210ENST00000588281 1776 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-214ENST00000591996 3062 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-205ENST00000586355 584 ntTSL 412.28□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 PGS1-203ENST00000586019 572 ntTSL 411.3□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.945e-8■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 518.35■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 NPEPL1-209ENST00000533788 899 ntTSL 517.37■□□□□ 0.375e-8■■■■■ 33.8
GTF2F1P35269 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 ACO2-205ENST00000478010 644 ntTSL 214.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 ACO2-206ENST00000481310 330 ntTSL 311.86□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.911e-11■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.021e-11■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)24.14■■□□□ 1.457e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 522.75■■□□□ 1.237e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.687e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.537e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 217.69■□□□□ 0.427e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.027e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-9■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.82■■■□□ 2.521e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)27.74■■■□□ 2.031e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 224.17■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 220.8■□□□□ 0.923e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 422.86■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 33.7
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 89.5 ms