Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BMI1P35226 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms