Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX2P32243 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX2P32243 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX2P32243 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
OTX2P32243 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX2P32243 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX2P32243 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX2P32243 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms