Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGA1P29973 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms