Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKBIAP25963 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKBIAP25963 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms