Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRHP20396 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRHP20396 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRHP20396 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRHP20396 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRHP20396 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRHP20396 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRHP20396 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRHP20396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRHP20396 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRHP20396 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRHP20396 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRHP20396 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRHP20396 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRHP20396 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRHP20396 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRHP20396 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRHP20396 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRHP20396 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRHP20396 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRHP20396 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRHP20396 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRHP20396 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRHP20396 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRHP20396 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRHP20396 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRHP20396 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRHP20396 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRHP20396 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRHP20396 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRHP20396 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRHP20396 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRHP20396 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRHP20396 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRHP20396 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TRHP20396 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRHP20396 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRHP20396 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRHP20396 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRHP20396 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRHP20396 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRHP20396 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRHP20396 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRHP20396 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRHP20396 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRHP20396 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRHP20396 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRHP20396 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRHP20396 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms