Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB4AP20338 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms