Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG1P18858 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG1P18858 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG1P18858 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG1P18858 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG1P18858 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG1P18858 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG1P18858 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG1P18858 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG1P18858 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG1P18858 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG1P18858 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG1P18858 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIG1P18858 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIG1P18858 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIG1P18858 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms