Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAV1P15498 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAV1P15498 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAV1P15498 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAV1P15498 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAV1P15498 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAV1P15498 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAV1P15498 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAV1P15498 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAV1P15498 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms